1)蛋白質(zhì)功能研究

 

　　在原子及電子傳遞層次，酶反應機理或蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用方面，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的經(jīng)典意義是深入理解其功能。隨著越來越多復雜大分子復合物及膜蛋白晶體結(jié)構(gòu)的解析，我們必將更加廣泛和深刻地理解生物學功能及生物界的起源、發(fā)生和發(fā)展規(guī)律。

 

　　2)基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計

 

　　根據(jù)已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行藥物設(shè)計和優(yōu)化，這種方法已經(jīng)被廣泛用于目標蛋白的選取和藥物的前期研發(fā)，并已成功研制出一些藥物用于臨床治療。大量蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的解析，尤其是蛋白激酶和具有重要功能的膜蛋白（如GPCR等）的結(jié)構(gòu)分析，將為基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計提供更多的工作靶標。此外，這些蛋白質(zhì)或其晶體可用于Fragment小分子的共結(jié)晶或浸泡篩選，它們復合物的晶體結(jié)構(gòu)將為藥物的優(yōu)化提供數(shù)據(jù)支持。

 

　　3)蛋白質(zhì)工程

 

　　通過對野生型及不同突變體的空間結(jié)構(gòu)的研究，根據(jù)需要對蛋白質(zhì)進行改造，設(shè)計活性更高或具有其他功能特性的蛋白質(zhì)分子。尤其是對于具有某一功能的家族的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究分析，對于更好地理解結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系是十分重要的。同時大量實驗數(shù)據(jù)的積累將為基于結(jié)構(gòu)的預測分析提供必要的理論依據(jù)。